Research Plan
1. Research title
Regulation of lipoxygenase gene expression under low oxygen condition in soybean
2. Research background
Soybean deterioration and the development of a stale flavor during storage are serious problems that reduce the quality of stored seeds. Fatty acids oxidation is the major cause for the aging in the soybean. The changes of the fatty acids mostly lie on the gene of soybean variety as well as the storage conditions such as temperature, humidity and atmosphere state.
Soybean lipoxygenase, greatly consist in mature embryo of the plant seed. Lipoxygenases (EC 1.13.11.-) are a family of iron-containing enzymes that catalyse the dioxygenation of polyunsaturated fatty acids in lipids containing a cis, cis-1,4- pentadiene structure. It catalyses the following reaction: fatty acid + O2 = fatty acid hydroperoxide. LOXs are also thought to play an important role in the formation of desirable or undesirable flavor and aroma in many plant products.
Low temperature, low O2 or high CO2 was reported to regulate the lox gene expression, especially the low O2 treatment which was able to suppress the accumulation of aging production including the total acid and fatty acid. Therefore, it is necessary to define the lox expression in different soybean varieties stored at the low O2 condition.
3. Current research condition
The PhD student will be expected to participate in the research project described above but more involved in the study on lox genes in soybean. The student will be mentored by a multidisciplinary science team led by Dr. Sangeeta Dhaubhadel. The other team members include Dr. Yuhai Cui, Dr. Robert Forster and Dr. David from AAFC-PARC. Dr. Dhaubhadel is a senior AAFC research scientist with over 30 years working experience and he has more than 10 years of experience in molecular plant virology, molecular biology and genetic engineering. His research areas have involved in plant breeding, plant tissue culture and molecular soybean breeding. Dr. Cui and Mr.
Forster are two major technical support staffs in the research team. Dr. Forster is an expert with 20 years of experience in plant transformation. Mr. David is good at lab management, experimental designs and techniques in molecular biology and biochemistry. The team is made up of disciplines in molecular biology, crop breading and plant biotechnology.
4. Research aims
The objective of this study is to analysis the gene sequence and expression of the lox3 in the soybean varieties stored in low O2 (1% O2) and low temperature. Several model soybean breed will be chosen in the express pattern of each lox3 gene and the adjust sequence will be found. The comparison would be carried among different lox3 gene in soybean through DNAstar software in order to select the key sequence area or gene point.
After that we will design the molecule marker regulating lox3 gene expression. Finally the impact of the low O2 on the lox3 gene expression and the key sequence area would be defined.
The knowledge gained from this research may lead to new approaches to design/ select soybean cultivar with increased or decreased lox3 levels, or to produce isoflavonoids in non-legume crops for human health and nutrition. Soybean is an important crop for both Canada and China, thus the outcome of the project will benefit both countries. The student will obtain high quality training for conducting research in molecular biology, functional genomics, transient and stable plant transformation, plant tissue culture and fruit chemistry.
5. Research methods
The present research aims to investigate the adductive effect of low O2 on the LOX enzyme activity and the lox3 gene expression during the storage period of the soybean. The conservative region of lipoxygenase gene (LOX) from seed total RNA of soybean was amplified using degenerate primers, which was combined with the ESTs of LOX genes from GeneBank, and the GSP primers would be designed after Blast aligning and sequence in stalling. Three full-length different cDNA sequences will be obtained, which were named PpLox1~3 (GenBank accession No.EU883638, FJ029110 and
FJ032015). The sequence analysis of the three members of soybean LOX gene family had a high homogeneous with other plant LOX genes in protein level, but high heterogeneous in nucleotide level. Phylogenetic tree based on LOXs in soybean. With the help of special lox3 gene, the adjustive sequence of lox gene in soybean treated with low O2 can be degraded; preventing translation of that transcript and, ultimately, expression of the gene.
6. Time plans
2011/12-2012/03
Gene primers design, construction and screening.
It includes (i) database (genomic and EST) searching for all lox3 gene sequence information related to soybean; (ii) analysis of the sequence information and design gene specific amiRNAs; (iii) making amiRNA constructs; (iv) screening and selection of high expressed amiRNA construct using transient expression assay system established in the Dhaubhadel laboratory in AAFC-PARC. The student will be trained in research reference study, research strategy development, experimental design and planning, bioinformatics analysis, molecular biology operation, etc.
2012/04-2012/12
Transformation and regeneration of soybean with plant amiRNA vectors.
It involves Agrobacterium-mediated plant transformation, plant tissue culture and plant regeneration, identification of different transgenic plant lines, and obtaining enough transgenic populations for functional genomic analysis, etc.
2013/01-2013/08
Functional analysis of lox3 genes.
It includes research in (i) detection of different amiRNA expressions in transgenic plant lines by RNA northern blot analysis; (ii) detection of mRNA productions of different lox genes in transgenic plant lines by reverse-transcript quantitative PCR (RT-qPCR) or RNA northern blot; (iii) detection of protein expressions of the lox; (iv) detection of LOX enzyme activities in different tissues of the transgenic plant lines; (v) soybean aging.
2013/09-2013/12
Data analysis and writing manuscripts for publication.
It includes data analysis, completion of research reports and scientific manuscripts. Some research publications could be promoted ahead of the schedule based on our research progress. Further collaborative research projects probably will be developed from this research for the student to carry on the directions in China.
7. Work introduction after returning to China
1. Finishing doctoral degree thesis;
2. Keeping studying in the research field and serving my motherland.
Supervisor:
Date: 3/16/2011
第二篇：198教育部「学海惜珠」-奖助大学校院选送清寒优秀学生出国研修计画
98??教育部「學海惜珠」-獎助大學校院選送清寒優秀學生
出國研修計畫
一、
二、
1.
2.
3. 目的：協助國內大學校院清寒優秀學生?加由學校安排之海外研修課程，前往姐妹校為一學期或一學?之交換生，體驗跨國文化，擴展國際視野。 申請人資格： 須具中華民國國籍，在臺灣地區設有戶籍。 持有效之低收入戶證明者（地方?政主管機構開?），或家庭經濟境遇特殊，能提出相關證明且經學校認定之清寒優秀學生。 申請及出國當學期須為在學學生（五專四、五?級，二技及四技，?含在職專班及
應屆畢業學生），惟出國研修之期限?得延長，於國外研修完畢須返回原薦送學校並取得學位。
在校學業成績優?（以每系所前百分之三十為原則）：操?總平均80分以上、大學4.
英檢成績240分以上(或等同之其他英語檢定成績)、??學業成績總平均達75分以上；在專業?域有研究著作或具體獲獎事蹟者。
5. 符合所選填姊妹校交換條件。
三、
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8. 請檢附以下文件一式四份(一份正本，三份影本，成績單及證書等證明文件繳交影本即可。)；A4格式；依序以訂書機裝訂於左上角；請勿膠裝或特殊裝訂： 戶籍謄本 財稅資?(國稅局開?之財產歸戶清單) 其它相關文件(如災害證明、?委會失業保險請?證明及師長推薦信等) 報名表(第一份正本須黏貼照片，其它三份影印即可。) 家長同意書正本 ?有系排名之中文??成績單 語言檢定成績證明（交件時請攜帶正本及影印本，正本驗證後歸還） 3頁內之中文個人??及?書計畫(註明申請原因、預期出國研修課程及目前學習之
相關性等)
9. 其它有?審查之文件，如服務志工、社團表現、或優?事蹟等（請提供四?以內之
證明，可雙面影印，交件時請攜帶正本，驗證後歸還）
書面資?繳交時間：98?2月2日~2月17日 (可郵寄)
報名資?繳交地點：國際合作交?中心 (至善?2?)
?絡人：許乃薇 (95197@mail.wtuc.edu.tw)
分機：2612
四、
1甄選?程：申請人須先通過書審，開學後由國合中心安排面試，再以書面及面試成績合併計分後公告?取名單。
五、 獎學?：
1. 出國期間，本校學雜費減免1/3。教育部核定之獎學?內含本校配合款，受獎生減免
之1/3學雜費，須計入本校配合款。
2. 獲本計畫補助經費之出國人員，?得同時或重複?取政府其他?學獎學?。
3. 申請德國美因茲及萊比錫大學之學生，如通過甄試且語檢成績達台德交換獎學?甄
試門檻，由本中心主動推薦申請該獎學?(學生仍須按規定繳交所需文件)。
4. 如未?加本校國際交換學生甄選，而逕?申請台德交換獎學?者，?得透過本校交
換生計畫出訪，亦?得享有交換生之各項權?，須依本校「文藻外語學院學生自覓國際交?機構進修期間學籍及學業處?要點」申請出國進修，出國期間應辦?休學，並自?向欲前往研修之德國大學提出入學申請，惟德國美因茲及萊比錫大學交換生名額出缺時，得由台德受獎生補足缺額，並取得交換生資格。
5. 各校交換生協議條件?一，請?考附件之〝甄選標準及名額一覽表〞之互惠條件及
注意事項。
?、 其它：
1. 獲本校薦送資格並?代表獲得教育部學海惜珠專案獎助資格，經甄選?取學生之申請
資?，須先送至教育部依審查條件評核，獎助學生及補助額?核定結果約於5月底公告。
2. 如未獲教育部?取學海惜珠獎學?，則取消交換生資格。如同意轉換成一般生身份，
?取它項獎助?，請在申請表上選填，其補助?額將依個人申請之交換學校、研習時間與甄選總成績等項目加權比重，由國合中心統籌分配。
3. 經?取之學生須於次學期出訪，惟法國普?旺斯大學及比?時新?汶大學之交換學生
之研修期間為下學期。
4. 交換學生須簽訂「?政?約書」，?於交換期間遭遇?可抗?之重大變故，欲提前回國，須先告知國合中心及交換學校請求同意。?取教育部獎學?者，如因未滿就?期限須退回獎學?者，請按相關規定辦?。
5. 交換學生出國前須?加國合中心舉辦之「?前?明會」，並於交換計畫結束返國後，按
要求繳交心得報告及辦?心得發表會，其它繳交文件依國合中心規定繳交。
6. 返國前後得應國合中心安排，義務擔任國際學生學伴(International Student Assistant,
ISA)，由國合中心負責分配與訓?。另外，也須配合各系安排?加?加語言競賽。
7. 選課、學分抵免依校內(文藻外語學院學生國際交?學籍及學分抵免處?要點)以及各系相關規定辦?。
8. 交換生須自?辦?出國手續、簽證、機票、住宿等。此外，?是每個交換學校?會安排接機，如果交換學校無法安排，交換生須自?前往學校報到。
2
各校交換學生互惠條件暨招收名額一覽表
1. 日本 學校名稱 ?田外國語 大學 Kanda University of International Studies
外語語檢特殊規定
符合日文系日語能?檢定標準畢業門檻。 (二技三?級同學以通過二級為主)
互惠條件及注意事項
1. 免繳對方學費。 2. 無提供食宿。
3. 該校提供交換生每月日幣2萬元?用?。(如有變動，依該校通知
為準。)
4. 學校網址：外語語檢特殊規定 研習時間 名額 符合日文系日語能?檢定標準畢業門檻。
(二技三?級同學以通過二級為主)
互惠條件及注意事項
限?性。
免繳對方學費。 提供免費宿舍。
學校網址：外語語檢特殊規定
一學?暫訂) 研習時間 一學期
名額 3
高知?子大學
Kochi Women's
1. University
2. 3. 4.
研習時間 一學?
名額 2
志學?大學Shigakukan University
符合日文系日語能?檢定標準畢業門檻。 (二技三?級同學以通過二級為主)
互惠條件及注意事項
1. 2. 3. 4.
免繳對方學雜費。
提供一學?免費學生宿舍及學生餐廳餐券（僅須負擔水電費）。學分認證須填寫UMAP學習計畫書。 學校網址外語語檢特殊規定
研習時間
名額
符合日文系日語能?檢定標準畢業門檻。 (二技三?級同學以通過二級為主)
純心?子大學Immaculate Heart College
1. 2. 3. 4.
互惠條件及注意事項
一學?暫定)
限?性。
免繳對方學費。
提供宿舍（自費，每個月付費日幣2萬元）。
可申請當地政府獎學?每月日幣4萬元。(如有變動，依該校通知為準。)
5. 學校網址：
外語語檢特殊規定 研習時間 名額
一學?
1(暫定)
清泉?子大學Seisen
University
符合日文系日語能?檢定標準畢業門檻。 (二技三?級同學以通過二級為主)
互惠條件及注意事項
1. 限?性。
3
2. 需繳對方學費一學?日幣30萬。
3. 提供宿舍（自費，每個月付費日幣6萬元，?包含管?費及電費則約需8萬日圓。伙食費則需自費）。
4. 每月可?獎學?日幣4萬元，可?10個月。(如有變動，依該校通知為準。)
5. 學校網址：
2. 韓國 學校名稱
無
培材大學 Pai Chai University
1. 2. 3. 4. 無
互惠條件及注意事項
1. 免繳對方學費。
2. 免費提供宿舍，食須自費。
3. 學校網址：其他外語語檢條件
研習時間 一學期
互惠條件及注意事項
免繳對方學雜費。
自付保險及社會??費用。 提供宿舍(自費)。
學校網址：其他外語語檢條件 研習時間
一學?
名額 2
韓國天主教
大學 Catholic University of Korea
3. 越南 學校名稱 河內國家大學所屬外國語 學院 National Vietnam University, Hanoi 胡志明市外語曁信息大學 Ho Chi Minh City University of Foreign Languages and Information Technology 胡志明市師範
大學 Ho Chi Minh
名額 2
其他外語語檢條件
無 1. 2. 3. 4. 5. 無
互惠條件及注意事項
研習時間 一學期
名額 2
互惠條件及注意事項
限大二以上學生報名。 免繳對方學費。
須選修該校外語系課程（中文專業課程與越語課程至少各一門）。另擔任每周至少4小時華語教學工作。 提供宿舍，食須自費。
學校網址：其他外語語檢條件 研習時間 名額
一學期
2
1. 限大二以上學生報名。
2. 免繳對方學費。
3. 須選修該校外語系課程（中文專業課程與越語課程至少各一門）。
另擔任每周至少4小時華語教學工作。 4. 學校網址：其他外語語檢條件
無
互惠條件及注意事項
4
研習時間 一學期
名額 2
City Normal University
1. 限大二以上學生報名。 2. 免繳對方學費。
3. 須選修該校外語系課程（中文專業課程與越語課程至少各一門）。
另擔任每周至少4小時華語教學工作。 4. 學校網址：
4. 馬?西亞 學校名稱
無
南方學院Southern College
互惠條件及注意事項
1. 2. 3. 4.
免繳對方學費。
須選修該校中文系相關課程。 免費提供宿舍，食須自費。
學校網址：其他外語語檢條件
研習時間 一學期
名額 2
5. 泰國 學校名稱
無
曼谷大學Bangkok University
6. 西班牙 學校名稱
無
其他外語語檢條件
研習時間 一學期
名額 4
(含2自費生)
互惠條件及注意事項
1. 免繳對方學費。
2. 秋季班開學為八月中。
3. 學校網址：其他外語語檢條件
研習時間 一學期
名額 2
薩?曼卡大學
互惠條件及注意事項 University of
1. 須繳對方學校語言課程學費。 Salamanca
2. 協助安排住宿（自費）。
3. 學校網址：其他外語語檢條件 研習時間 那瓦?公?大
學 Universidad
Publica de Navarra
7. 英國 學校名稱 渥夫漢普頓 大學 University of
名額 2
無
1. 免繳對方學雜費。 2. 無提供食宿。
3. 學校網址：一學?
互惠條件及注意事項
其他外語語檢條件
無
互惠條件及注意事項
1. 須繳對方學費，一學期約為? 2,970。
5
研習時間 一學期
名額 2
提供宿舍(自費，一學期約為? 2,800)
3. 學校網址：
8. 比?時 學校名稱 布??爾口筆譯高等學院 Institut Supérieur de traducteurs et interprètes, ISTI 新?汶大學 Universitè Catholique de Louvain, UCL
9. 法國 學校名稱
無
南特大學
互惠條件及注意事項
其他外語語檢條件
研習時間 一學?
名額 2
無
互惠條件及注意事項
1. 免繳對方學雜費。
2. 提供單人房宿舍（自費，每個月收費270歐元） 3. 學校網址：
其他外語語檢條件
無
互惠條件及注意事項
1. 免繳對方學雜費。 2. 無提供食宿。
3. 學校網址：研習時間 一學期
名額 下學期：3
其他外語語檢條件
研習時間 一學期
名額 4
1. 免繳對方學雜費。
Nantes 2. 交換生於語言學校上課，須繳交註冊費630歐元、學費195.7歐University 元，以及保險費189歐元。
3. 無提供食宿。
4. 學校?考網址：其他外語語檢條件 研習時間 名額 普?旺斯大學
一學期 下學期：6The University 無
互惠條件及注意事項 of Provence
(Aix-Marseille 1. 免繳對方學雜費。
2. 無提供食宿。
I)
3. 學校網址：其他外語語檢條件 研習時間 ?昂第二大學 無
互惠條件及注意事項 Université
Lumière Lyon 2 1. 免繳對方學雜費。
2. 無提供食宿。
3. 學校網址：
6
名額 4
一學期
10. 美國 學校名稱 外語語檢特殊規定 研習時間 名額
須提供托?PBT 550或同等網?測驗以上
一學期 2 之成績證明。?能以大學英檢或其他語檢替
代。
互惠條件及注意事項
1. 免繳對方學費。
2. 提供宿舍（須自費，一學期含膳食收費約US $ 3,750）。
3. 經?取者，申請時須提供新台幣20萬元以上銀?存款證明。
4. 春季班開學為一月。
5. 學校網址：外語語檢特殊規定 研習時間 名額
須提供托?PBT 550或同等網?測驗以上
一學期 5 之成績證明。(大專英檢成績如有315以上
也可申請)
互惠條件及注意事項
1. 免繳對方學費，但需付其他相關費用如國際學生費、電腦及網?
資源費等，約US$1,000。
2. 提供宿舍（須自費，一學期含膳食收費約US $ 4,007）。
3. 春季班開學為一月。
4. 學校網址：衛斯?安學院Wesleyan College 布納維斯塔 大學 Buena Vista University
11. 德國
學校名稱 外語語檢特殊規定 研習時間 名額
一學期 6 初級德語檢定考試通過尚可等級。
互惠條件及注意事項 美因茲大學 1. 免繳對方學費 。 Johannes ，食須自費。於申請入學許可時提出住宿申請。Gutenberg 2. 提供宿舍（自費）
Universit?t 3. 甄選德國交換生經?取者，校內交換獎學?最多可補助4個公費
生。如語檢成績達台德交換獎學?甄試門檻，可另外提出申請該Mainz 獎學?，但?得重覆?取校內交換獎學?。
4. 學校網址：外語語檢特殊規定 研習時間 名額
一學期 2 初級德語檢定考試通過尚可等級。
互惠條件及注意事項
1. 免繳對方學費。
2. 提供宿舍（自費），食須自費。
3. 甄選德國交換生經?取者，校內交換獎學?最多可補助4個公費
生。如語檢成績達台德交換獎學?甄試門檻，可另外提出申請該
獎學?，但?得重覆?取校內交換獎學?。
4. 學校網址：萊比錫大學 Universit?t Leipzig
7
12. 波? 學校名稱
克?柯夫大學
The Andrzej
Frycz
Modrzewski
Krakow
University
College
13. 捷克 學校名稱
無 其他外語語檢條件 無 互惠條件及注意事項 1. 一學期學費約500歐元。 2. 沒有宿舍，但可協助安排校外學生公寓（須自費，一學期收費約300~400歐元）。 3. 網址研習時間 一學期 名額 2 其他外語語檢條件 研習時間 一學期 名額 4
互惠條件及注意事項 克??夫大學
（University of 1. 免繳對方學雜費。
2. 提供3人房宿舍（自費，每個月收費捷克幣2,405元，約USD 120）。Hradec 3. 可研修課程以資管及商學院所開為主。 Kralove） 4. 學校網址：5. Buddy System website：
8