检测HBV-DNA临床意义:
一、HBV-DNA与两对半的关系
1、HBsAg(+)、HBeAg(+)提示HBV复制活跃和传染性强。
2、HBsAg(–)、HBeAg(–)、HBsAb、HBeAb出现是机体清除HBV标志,并且提示机体对HBV的免疫力。
3、HBsAg(–)、HBsAb(+)、HBeAb(+)、HBcAb(+)呈不同组合的血清学状态,结果均考虑肝病行肝活检证实为慢性肝炎改变、免疫组化检出HBV抗原。其HBV-DNA阳性率29.0% ,肝内检出率65% 。
4、HBsAg(–)、HBeAg(–)、HBV-DNA(+)是由于HBV S区点突变可能导致HBsAg抗原性改变,使HBsAg不能被检出,而HBV前C区基因变异,使HBsAg不能表达但病毒本身复制不受影响。
5、HBsAg(+)、HBV-DNA(–)可能是HBV-DNA整合于宿主细胞基因组, 或基因变异,所用PCR引物不匹配,未能检出但仍可表达HBsAg
6、HBsAb(+)、HBeAb(+)/(–)、HBcAb(+)表明已进入恢复期或痊愈期,但仍有HBV-DNA(+)可能是病毒突变所致。
二、HBV-DNA拷贝数与临床治疗的关系
1、HBV-DNA拷贝数由高到低表示药物对患者治疗有效和治疗方案的正确。
2、治疗后HBV-DNA拷贝数下降到103-102时停止抗病毒治疗,但应做到2-4 个月复查HBV-DNA和肝功能,以监测HBV复制情况和肝脏是否受损。
3、 抗肝炎病毒药物只能使HBeAg阴转,不能阴转HBsAg,长期抗病毒治疗有可能使HBV-DNA阴性,但HBsAg阳性,是因为HBsAg和HBeAg虽然是与病原体有关的抗原成分,但存在于血液中的HBsAg绝大部分为不含病毒的小圆形颗粒,只有极少部分(0.2%)为丹氏(Dane)颗粒。而乙肝病毒前C区的变异则常常导致HBeAg表达的缺失。至于血清中抗体含量的高低与病原体的含量更没有直接关系,机体免疫应答的滞后性使得即使有高滴度的抗体存在,也可能病原体含量很低或根本就已消失。因此对于乙肝疾病,判断疗效的唯一标志只能是病原体本身的定量检测,如HBV-DNA
第二篇:SCGE法检测DNA损伤(包括DNA单链断裂和DNA交联)revised_1_
SCGE法检测DNA损伤
SCGE的原理(中性电泳液,高盐和变性剂检测双链断裂;碱性检测单链,双链断裂和碱不稳定性) SCGE技术是一种在单细胞水平上检测有核细胞DNA损伤和修复的方法。该技术的原理是基于有核细胞的DNA分子量很大,DNA超螺旋结构附着在核基质中,用琼脂糖凝胶将细胞包埋在载玻片上,在细胞裂解液作用下,细胞膜、核膜及其它生物膜破坏,使细胞内的RNA、蛋白质及其它成分进入凝胶,继而扩散到裂解液中,唯独核DNA仍保持缠绕的环区(Loop)附着在剩余的核骨架上,并留在原位。如果细胞未受损伤,电泳中核DNA因其分子量大停留在核基质中,经荧光染色后呈现圆形的荧光团,无拖尾现象。
若细胞受损,在中性电泳液(pH8)中,核DNA仍保持双螺旋结构,偶有单链断裂(SSBs)并不影响DNA双螺旋大分子的连续性。只有当DNA双链断裂(DSBs)时,其断片进入凝胶中,电泳时断片向阳极迁移,形成荧光拖尾现象,形似彗星。如果在碱性电泳液(pH>13)中,先是DNA双链解螺旋且碱变性为单链,单链断裂的碎片分子量小即可进入凝胶中,在电泳时断链或碎片离开核DNA向阳极迁移,形成拖尾。细胞核DNA受损愈重,产生的断链或碱易变性断片就愈多,其断链或断片也就愈小,在电场作用下迁移的DNA量多,迁移的距离长,表现为尾长增加和尾部荧光强度增强。因此,通过测定DNA迁移部分的光密度或迁移长度就可定量测定单个细胞DNA损伤程度。
1. 仪器及试剂
冰箱,载玻片,水平电泳槽,荧光显微镜。
不含Ca2+、Mg2+的PBS (PH=7.4);正常溶点琼脂糖(NMA)及低溶点琼脂糖(LMA)(0.6%溶于PBS);细胞裂解液(2.5 M NaCl, 100 mM Na2EDTA, 10 mM Tris-HCl, 1%肌氨酸钠, PH=10, 用前加1% TritonX-100, 10% 二甲亚砜(DMSO));电泳缓冲液(0.3 M NaOH, 1 mM Na2EDTA, PH=13);0.4 M Tris-HCl(PH=7.5); 无水乙醇;20-30μg/mL 溴化乙锭(EB)。
2. 样品
在体外实验中,将对数期生长的细胞用0.25%胰蛋白酶消化,收集细胞备用(悬浮细胞直接离心收集)。在体内实验中,取需测试的脏器或组织,用磷酸缓冲液( PBS,PH 7.4) 洗净后,剪至糜状滴加PBS(PH 7.4) 研磨,过300 目筛子,收集细胞,悬浮于PBS(PH 7.4) 中, 细胞密度为(1-5) x 104-6个/ mL (40倍物镜下单个视野内4-8个细胞)。
3. 制胶(当40倍物镜下单个视野内细胞数为4-8个时,细胞液与LMA的比例为1:7.5;可根据细胞密度,适当调整细胞液和LMA的量)
将载玻片用砂纸(粒度No. 380)磨出痕迹, 以便凝胶附着. 将37C正常溶点0.6%琼脂糖液(溶于不含Ca2+、Mg2+的PBS,需要沸水加热3h以上)60-100μl铺展(用玻璃棒轻轻向一端平推)到预热的磨痕载玻片上,作为第一层凝胶。加入制备的细胞悬液45-80μl(10μl细胞悬液和75μl 0.6%的低熔点琼脂糖(LMA) 在37℃混匀)铺展到载玻片上作为第二层, 盖上盖玻片,放在冰袋上 凝固后轻轻揭掉盖玻片,再铺展低溶点0.6%琼脂糖45-80μl作为第三层, 使载玻片上琼脂糖呈“三夹层”式.
(注意:NMA 适宜浓度0. 5 %~1 % ,过高或过低将造成凝固速度过快而不易铺平或粘着力低而脱落,铺胶前载玻片预热,有利于铺植平整。LMA 凝胶浓度直接关系到DNA 迁移长度 ,0. 6 % 较适宜。第3 层LMA 可不铺。微量加样器吸头前端残留凝胶勿吹出,以防形成气泡。移去盖玻片时注意勿损伤胶膜)
4. 裂解(裂解液最好当天配制,一定要在4℃预冷;从这一步开始,动作要尽量轻缓,以防脱胶;一定要避光,所以当玻片浸入裂解液后放入4℃冰箱内裂解2h)
4℃凝固后去掉盖玻片,将载玻片浸人新配制的4℃预冷细胞裂解液(含2.5M NaCl, 100mM Na2EDTA, 10mM
Tris-HCl(PH=10),用前加1% TritonX-100, 10% 二甲亚砜(DMSO)),裂解2h。此步骤的目的即是溶解细胞膜及核膜,除去蛋白质、RNA 等,仅存留核骨架。
5. 电泳(电泳液可回收重复利用)
裂解后将玻片并列置于水平电泳槽中,电泳缓冲液(0.3M NaOH、1mM EDTA)盖过胶面,静置20min解链。之后接通电源,电泳条件25V,300mA,时间20-40分钟。通过调节液面来调电压。(电压先调到最大,电流300mA,然后通过液面来调节电压)。
(注意:电泳时电压、电流及时间的长短会直接影响DNA 迁移长度,造成假阳性或假阴性。文献报道为18~50 V ,200~300 mA ,20~40 min。我们采用25 V ,300 mA ,20min ,效果良好。电泳进行中应持续监测,吸出或加入电泳液,调节液面高度,保持电压与电流的恒定)
6. 染色
电泳结束后,将玻片浸入0.4 M Tris-HCl (PH=7.5)中30min, 每片滴加50μl 20-30μg/ml的EB染色15~20min,盖上盖玻片在荧光显微镜下观察。24小时内检测,时间过长将导致荧光褪色。
(注意:可在染色后4 ℃避光潮湿条件下保存,数日后观察。但我们通过实践得出为防止荧光衰减,尽快阅片较好。阅片过程中,由于淬灭效应,荧光减弱很快,因此操作必须紧凑。结果可直接在荧光显微镜下分析,或先摄影,再进行照片分析。但摄影、相片冲洗条件等较难控制统一,因此应尽量直接分析)
以上除中和及染色外,各步均应在暗处进行,以避免额外的DNA损伤。应尽快阅片,时间过长将导致荧光褪色。
7.观察
使用100W汞灯作为荧光光源,在荧光显微镜(激发波长为549nm,发射波长为590nm)下,损伤的细胞DNA呈现由圆形、致密红色核心(慧头)和朝向阳极的尾端DNA碎片(慧尾)构成的“慧星”。常选用DNA断裂分级和DNA慧星尾长两种观察指标。
DNA彗星头部直径和慧星尾长是在高倍镜下直接测量出“慧头”中心到“慧尾”的长度(单位“格数”)。DNA慧星尾长:每片随机测量25个“慧星”尾长,计算均数。
DNA断裂分级:按彗星尾部与头部直径的比例来判断,共分为5个等级(分别给0-4分值)
零级损伤:无断裂级损伤(即正常的,没有彗尾),计0分
一级损伤:有轻微的彗尾,彗尾短于彗星头部直径的1/4,计1分
二级损伤:彗尾大于彗星头部直径的1/4,小于彗星头部直径,计2分
三级损伤:彗尾长度大于彗星头部直径,计3分
四级损伤:彗星只有很小的头部,计4分
每片随机计数50个“慧星”,统计各级彗星的个数,将各级彗星的细胞数与各级对应分值的乘积累加起来,用累加值与200(50个细胞乘以最大分值4分)的比值来衡量DNA损伤程度(尾部DNA损伤占总DNA损伤的比例)。例如,50个细胞都是4级损伤,则DNA损伤程度=50×4/200×100%=100%;若10个细胞是2级损伤,6个3级损伤,7个4级损伤,则DNA损伤程度=(10×2+6×3+7×4)/200×100%=33%